Управление подпрограммой осуществляют государственные заказчики: Государственный комитет Российской Федерации по строительству и жилищно-коммунальному комплексу - по памятникам градостроительства, архитектуры, инженерного искусства и прочим объектам недвижимости, Министерство культуры Российской Федерации по иным объектам исторического и культурного наследия.
Государственные заказчики ежегодно организуют и проводят конкурсы по отбору предложений исторических городов, исполнителей и поставщиков в целях обеспечения наиболее выгодного размещения заказов на поставку продукции для федеральных государственных нужд по каждому программному мероприятию. К работе в конкурсной комиссии будут привлекаться представители Министерства экономического развития и торговли Российской Федерации и Министерства финансов Российской Федерации. Победители конкурса заключают договоры с государственными заказчиками (в соответствии с видом работ).
При необходимости государственные заказчики вносят в установленном порядке в Правительство Российской Федерации предложения об уточнении сроков и промежуточных этапов реализации подпрограммы, ее продлении и завершении, согласованные с Министерством экономического развития и торговли Российской Федерации и Министерством финансов Российской Федерации.
Для осуществления контроля и оценки хода реализации подпрограммы исполнители представляют государственным заказчикам информацию о ходе выполнения программных мероприятий.
Государственные заказчики ежегодно представляют в Министерство экономического развития и торговли Российской Федерации проект доклада о ходе реализации программных мероприятий и использовании средств из всех источников финансирования для последующего внесения в Правительство Российской Федерации.