Работы по развитию ГАС "Выборы", а также затраты на ее эксплуатацию и системную поддержку осуществляются за счет средств федерального бюджета, при этом возможно привлечение средств бюджетов субъектов Российской Федерации и органов местного самоуправления, внебюджетных источников. При разработке проекта, реализуемого в рамках мероприятий Программы, должен быть выработан реальный механизм самоокупаемости затрат на создание и эксплуатацию системы и долевого участия федеральных органов управления, органов управления субъектов Российской Федерации и местного самоуправления в финансировании работ.
Обоснование финансовых затрат, источников финансирования, ресурсного обеспечения должно проводиться перед реализацией каждого этапа Программы.
Концепция развития ГАС "Выборы" на 2001 - 2004 годы разработана ФЦИ при участии избирательных комиссий субъектов Российской Федерации, ученых Российской академии наук, специалистов отраслевых организаций, учреждений и научно-исследовательских институтов.