5. Производство дознания по наиболее сложным, многоэпизодным (регионального значения) делам о контрабанде и об иных преступлениях, отнесенных к компетенции таможенных органов.
6. Производство по делам о НТП особой важности и наиболее сложным, многоэпизодным (регионального значения) делам о НТП.
7. Рассмотрение материалов с признаками контрабанды и иных преступлений в области таможенного дела либо НТП для установления признаков преступления и проведения расследования или заведения дела о НТП.
8. Исполнение отдельных поручений по уголовным делам и поручений по делам о НТП (при отсутствии соответствующего подразделения в оперативной таможне).
9. Участие на основании постановления прокурора в работе следственных групп правоохранительных органов, создаваемых для расследования наиболее сложных преступлений в области таможенного дела.
10. Участие в мероприятиях, проводимых другими подразделениями оперативной таможни, по выявлению и пресечению таможенных преступлений и правонарушений.
11. Ведение журнала, регистрация и хранение согласно порядку, определяемому приказами ГТК России, дел о НТП (актов применения взыскания по упрощенной форме), производство по которым велось подразделениями оперативной таможни или регионального таможенного управления,
12. Ведение дел по номенклатуре, утвержденной начальником оперативной таможни.