К участию в реализации Программы привлекаются федеральные органы исполнительной власти и органы исполнительной власти субъектов Российской Федерации, различные организации, в том числе научные учреждения.
Текущее управление осуществляется дирекцией Программы, возглавляемой заместителем Министра здравоохранения Российской Федерации, ответственным за реализацию Программы.
Реализация Программы осуществляется на основе государственных контрактов (договоров), заключаемых в установленном порядке Министерством здравоохранения Российской Федерации со всеми исполнителями программных мероприятий.
Исполнители отдельных мероприятий Программы определяются в установленном порядке на конкурсной основе.
Министерство здравоохранения Российской Федерации с учетом выделяемых на реализацию Программы финансовых средств ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации Программы и состав исполнителей.