Центр самостоятельно осуществляет свою деятельность в пределах, определяемых законодательством Российской Федерации, нормативными актами ГТК России и настоящим Положением. Центр строит свои отношения с другими организациями и гражданами во всех сферах деятельности на основе договоров.
Для реализации возложенных функций Центр имеет право:
5.1. Подготавливать по вопросам своей деятельности проекты приказов, распоряжений и других правовых актов и представлять их на рассмотрение и утверждение руководству СЗТУ.
5.2. Запрашивать от таможенных органов региона информацию в пределах своей компетенции.Обобщать, анализировать, вырабатывать меры по совершенствованию работы в области программного и информационно-технического обеспечения и защиты информации таможенных органов. Вносить руководству СЗТУ и ГТК России предложения об информационно-техническом обеспечении таможенных органов.
5.3. Взаимодействовать в пределах своей компетенции в регионе с государственными органами, организациями и должностными лицами. Осуществлять взаимодействие в вопросах информационно-технического обеспечения с подразделениями ГТК России, таможенными органами, организациями, подведомственными ГТК России.
5.4. Защищать права, имущественные и иные интересы в судах, арбитражных судах и других организациях при рассмотрении исков, жалоб по делам, возникающим в процессе административно-правовых отношений.
5.5. Заключать в пределах своей компетенции и выделенных денежных средств с организациями и гражданами договоры, связанные с хозяйственной или иной деятельностью в соответствии с законодательством Российской Федерации.
5.6. Центр обладает другими правами, предусмотренными законодательством Российской Федерации, правовыми актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, нормативными актами ГТК России.