Текущее управление Программой осуществляется ОАО "Научно-исследовательский институт пластмасс им.Г.С.Петрова" по согласованию с Департаментом науки и промышленной политики.
Контроль за исполнением Программы осуществляет Департамент науки и промышленной политики (в полном объеме) ОАО "МКНТ" (в части эффективности расходования средств городского бюджета по заключенным с ним договорам), Москомприрода (в части соответствия экологическим требованиям разработок по Программе).
Городскими заказчиками и пользователями Программы являются Департамент науки и промышленной политики, Комитет здравоохранения, Предприятия жилищно-коммунального хозяйства, Управление топливно-энергетического хозяйства