Ст.14. Руководство дознанием осуществляет командир воинской части, возбудивший уголовное дело, который обязан давать дознавателю указания о том, что именно подлежит установлению и в каком объеме; какие следственные действия необходимо произвести и когда должно быть закончено дознание.
Ст.15. В целях улучшения качества производства дознаний командир воинской части изучает работу дознавателей, принимает меры по ее совершенствованию и устранению недочетов, организует занятия по повышению юридической подготовки дознавателей. Для получения практических навыков по расследованию преступления дознаватели по плану командира воинской части, согласованному с военным прокурором, участвуют в учебных сборах дознавателей и проходят ежегодную стажировку сроком 10 дней в военной прокуратуре.
Ст.16. Вышестоящие командиры и начальники обязаны заботиться о повышении юридической подготовки командиров воинских частей, включать ее в планы командирской учебы, ежегодно подводить итоги работы органов дознания и принимать меры к ее улучшению, отражать в служебных аттестациях деятельность органов дознания и дознавателей. В случае обнаружения нарушений уголовно-процессуального законодательства при производстве дознания вышестоящий командир ставит об этом в известность военного прокурора, который принимает меры к восстановлению нарушенной законности.
Ст.17. В соответствии со ст.2 Закона Российской Федерации "О прокуратуре Российской Федерации" надзор за точным исполнением законов органами дознания, действующими в Вооруженных Силах Российской Федерации, осуществляют военные прокуратуры.
Оценка деятельности командира воинской части как органа дознания дается вышестоящим командиром по согласованию с военным прокурором.
Ст.18. Действия командира воинской части и дознавателя в связи с производством дознания могут быть обжалованы заинтересованными лицами военному прокурору (ст.22 УПК РФ).
Жалобы могут быть как письменные, так и устные. Устные жалобы заносятся в протокол, который подписывается заявителем и лицом, принявшим жалобу. Дознаватель обязан в течение 24 часов через командира воинской части направить поступившую жалобу со своими пояснениями военному прокурору.
Принесение жалобы впредь до ее разрешения не приостанавливает приведение в исполнение обжалуемого действия, если этого не найдут нужным сделать командир воинской части или дознаватель (ст.218 УПК РФ).