4.1. Департамент подчиняется первому заместителю Премьера Правительства Москвы - руководителю Комплекса социальной сферы.
4.2. Департамент возглавляет руководитель Департамента муниципального жилья и жилищной политики, назначаемый и освобождаемый от должности Мэром Москвы по представлению первого заместителя Премьера Правительства Москвы - руководителя Комплекса социальной сферы.
Первый заместитель и заместители руководителя Департамента назначаются и освобождаются от должности Премьером Правительства Москвы по представлению руководителя Департамента.
4.3. Управления муниципального жилья административных округов не являются самостоятельными юридическими лицами и выполняют функции территориальных отделений Департамента.
Начальники управлений являются заместителями руководителя Департамента, которые назначаются и освобождаются от должности Премьером Правительства Москвы по представлению руководителя Департамента и согласованию с префектами соответствующих административных округов.
4.4. В Департаменте образуется Коллегия, состав и положение о которой утверждаются руководителем Департамента.
4.5. При реорганизации Департамента архивные документы в упорядоченном состоянии передаются правопреемникам, а при ликвидации - архивным учреждениям города в установленном порядке.
4.6. Прекращение деятельности Департамента может быть осуществлено по распоряжению Мэра Москвы.