Общий контроль за реализацией Программы осуществляется Министерством внутренних дел Российской Федерации.
Исполнители мероприятий, указанные в графе "Исполнитель" раздела "Основные программные мероприятия" первыми, могут создавать межведомственные группы, работу которых они организуют и контролируют с представлением отчетов в установленные сроки.
Государственные заказчики и исполнители мероприятий Программы несут ответственность за их качественное и своевременное выполнение, рациональное использование финансовых средств и ресурсов, выделяемых на реализацию Программы.
При отсутствии финансирования мероприятий Программы государственные заказчики и исполнители по согласованию с государственным заказчиком-координатором вносят в Правительство Российской Федерации предложения об изменении сроков их реализации либо снятии с контроля.
Федеральные органы исполнительной власти, организации и учреждения, ответственные за выполнение мероприятий, представляют в Министерство внутренних дел Российской Федерации к 10 июля 1999 г., 10 января 2000 г., 10 июля 2000 г. и 10 января 2001 г. отчеты о ходе работы.
Отчеты о ходе выполнения мероприятий, исполнителями которых являются органы исполнительной власти субъектов Российской Федерации, представляют федеральные органы исполнительной власти, указанные вторыми в графе "Исполнитель" раздела "Основные программные мероприятия".
По итогам реализации мероприятий Программы Министерство внутренних дел Российской Федерации до 1 февраля 2000 г. и 1 февраля 2001 г. представляет в Министерство экономики Российской Федерации и Министерство финансов Российской Федерации информацию, а Министерство экономики Российской Федерации с участием Министерства финансов Российской Федерации до 1 марта 2000 г. и 1 марта 2001 г. представляет доклад в Правительство Российской Федерации.
Ход и результаты выполнения мероприятий Программы по решению Председателя Правительства Российской Федерации могут быть рассмотрены на заседаниях Правительства Российской Федерации и его Президиума с заслушиванием отчетов руководителей федеральных органов исполнительной власти - государственных заказчиков и исполнителей Программы.