Регулярная оценка состояния морской среды имеет особенно большое значение в условиях все возрастающей нагрузки на среду, что вызывается расширением освоения нефтегазовых ресурсов на шельфе морей Российской Федерации, предстоящим строительством газопровода по дну Балтийского моря и другими причинами.
На фоне коротко- и долгопериодных естественных флуктуаций состояния морской среды, формирующих гидрохимическую основу биопродуктивности морских экосистем и развитие морской биоты, в настоящее время сильнейшее воздействие на экосистемы морей России и, соответственно, на морское биоразнообразие, состав и структуру биологических сообществ оказывают добыча морских биоресурсов, масштабное браконьерство и все возрастающая промышленно-хозяйственная активность в прибрежных зонах и на шельфе, связанная с разведкой, добычей и транспортировкой углеводородного сырья, увеличением потока морского транспорта, прибрежного рыболовства и количества марикультурных хозяйств. Полученные данные свидетельствуют о кризисных изменениях функциональных характеристик морских экосистем и трофической структуры сообществ, вызванных чрезмерным выловом донных беспозвоночных животных и рыб, антропогенным загрязнением, вселением чужеродных видов микрофлоры и беспозвоночных животных из балластных вод и обрастания судов. Особенно это касается заливов и бухт, которые имеют сложные гидродинамику и гидрохимический режим. Именно в эти высокопродуктивные районы, которые менее всего пригодны для антропогенных стоков, поступает основной объем бытовых и техногенных отходов, создавая очаги локального или регионального загрязнения и нарушая естественный ход биологических процессов в море. В то же время заливы, бухты и эстуарии используются морскими хозяйствами для искусственного выращивания донных водорослей-макрофитов, беспозвоночных животных и рыб, что в течение короткого времени приводит к гиперэвтрофикации водоема, гибели аборигенных сообществ морских организмов и появлению токсической микрофлоры, в том числе опасной для человека.
Основными мероприятиями по указанному направлению являются:
анализ влияния крупномасштабной добычи и транспортировки углеводородов на экосистемы и биоресурсы шельфовой зоны морей России, выработка механизмов смягчения последствий нефтегазодобычи на окружающую среду и биоту;
анализ, изучение и разработка методов и средств для дистанционного мониторинга состояния и загрязнения прибрежных вод Российской Федерации и других районов Мирового океана;
разработка системы экологически устойчивого морского природопользования в северо-западных морях России (Баренцевом, Печорском, Белом, Балтийском морях и в акватории архипелага Шпицберген) на основе современных биологических и информационных технологий;
разработка системы оценки и минимизации экологических рисков, связанных с действием естественных климатических и антропогенных факторов в Черном и Азовском морях;
определение основ экологической безопасности морских экосистем и комплекса мероприятий по сохранению биологических ресурсов морей Российской Федерации;
определение влияния массового развития видов-вселенцев, вредоносных и токсических организмов на состояние морских экосистем, оценка экологических и экономических последствий развития инородных организмов, приводящих к катастрофическому снижению продуктивности, естественного биоразнообразия, качества морской среды и ее пользовательских свойств, хозяйственного потенциала.