Функции контроля инспекторские органы осуществляют на основании соответствующих Положений об инспекторских органах в соответствии с настоящей Инструкцией и соглашениями о взаимодействии с государственными контролирующими органами Минприроды России, Государственного комитета Российской Федерации по антимонопольной политике и поддержке новых экономических структур, Государственного таможенного комитета Российской Федерации, органами прокуратуры Российской Федерации, другими государственными органами контроля, а также с органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации.
Органы Российской транспортной инспекции Министерства транспорта Российской Федерации осуществляют контроль за соблюдением установленного Советом Министров - Правительством Российской Федерации и Минтрансом России порядка лицензирования региональными органами, осуществляющими его, и качества контроля за исполнением лицензий.