Выполнение функций государственного заказчика по разработке и реализации с участием заинтересованных федеральных органов исполнительной власти и органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации федеральной программы поэтапного уничтожения запасов химического оружия, хранящихся на территории Российской Федерации.
Выбор оптимальных технологий уничтожения химического оружия на основе конкурса отечественных и зарубежных разработок.
Организация проектирования, строительства объектов по уничтожению запасов химического оружия в комплексе с объектами специальной и социальной инфраструктуры, необходимыми природоохранными сооружениями и объектами лечебно-профилактического назначения.
Эксплуатация объектов по уничтожению химического оружия, в том числе совместно с Комитетом Российской Федерации по химической и нефтехимической промышленности и Государственным комитетом Российской Федерации по оборонным отраслям промышленности, промышленных зон этих объектов, включая подготовку персонала для их эксплуатации и обслуживания.
Обеспечение готовности объектов по хранению и уничтожению химического оружия к международным инспекциям.
Обеспечение безопасного хранения запасов химического оружия до полного их уничтожения.
Проведение с участием федеральных органов исполнительной власти, органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации мероприятий по информированию населения и общественных объединений по вопросам обеспечения безопасности населения и защиты окружающей среды при проведении работ с химическим оружием в местах его хранения и уничтожения.