Средства на содержание Счетной палаты предусматриваются в федеральном бюджете отдельной строкой.
Контроль за использованием Счетной палатой средств федерального бюджета осуществляется на основании решений Президента Российской Федерации, постановлений Совета Федерации и (или) постановлений Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации (часть дополнительно включена с 25 июля 2007 года Федеральным законом от 21 июля 2007 года N 190-ФЗ).
Постановление Совета Федерации и (или) постановление Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации по вопросу об осуществлении контроля за использованием Счетной палатой средств федерального бюджета, выделенных на ее содержание, принимаются по инициативе не менее одной пятой общего числа членов Совета Федерации и (или) депутатов Государственной Думы (часть дополнительно включена с 25 июля 2007 года Федеральным законом от 21 июля 2007 года N 190-ФЗ).