Научное обеспечение агропромышленного комплекса возлагается на Российскую академию сельскохозяйственных наук, Министерство сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации и Комитет Российской Федерации по земельным ресурсам и землеустройству.
Российская академия сельскохозяйственных наук обеспечивает организацию и проведение фундамельтальных и важнейших прикладных исследований. На нее возложено научно-методическое руководство всеми научными исследованиями независимо от ведомственной принадлежности их исполнителей, подготовка научных кадров и научно-техническое сотрудничество с зарубежными странами. Совместно с Министерством сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации, Министерством экономики Российской Федерации, Министерством науки и технической политики Российской Федерации и другими министерствами и ведомствами Российской Федерации она формирует государственную научно-техническую политику в аграрном секторе, разрабатывает методы, формы и условия реализации достижений науки и техники в производство.
В новых условиях вся прикладная аграрная наука должна быть интегрирована с сельскохозяйственными товаропроизводителями.
Государственными заказчиками на прикладные научные исследования выступают Министерство сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации, Комитет Российской Федерации по земельным ресурсам и землеустройству, а также органы исполнительной власти субъектов Российской Федерации. Эти исследования финансируются из специального фонда Министерства сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации, формируемого за счет бюджетных и внебюджетных ассигнований.
Научное обеспечение агропромышленного комплекса реализуется через механизм государственных, отраслевых и региональных научно-технических программ, разрабатываемых по заказам производства научными учреждениями и коллективами ученых и выполняемых на конкурсной основе.
Министерству сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации и Российской академии сельскохозяйственных наук разрешается по согласованию с Министерством экономики Российской Федерации и Министерством финансов Российской Федерации использовать в установленных размерах централизованные капиталовложения на реализацию государственных и региональных целевых научно-технических программ.
Для разработки, финансирования и реализации комплексных и целевых научно-технических программ, научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ (услуг) создаются отраслевые и межотраслевые внебюджетные фонды научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ. Указанные внебюджетные фонды формируются за счет отчислений предприятий и организаций независимо от форм собственности в размере до 1,5 процента себестоимости реализуемой продукции (работ, услуг). Образование и использование отраслевых и межотраслевых внебюджетных фондов научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ осуществляется в соответствии с установленным порядком.
Предусматривается создание государственных научных центров, государственных аграрных университетов и других учреждений на базе интеграции образования, науки и производства.
Консультационная деятельность будет развиваться на базе создаваемых в регионах информационно-консультационных центров по обслуживанию сельскохозяйственных товаропроизводителей и осуществляться как государственными, так и различного рода коммерческими структурами. Затраты на содержание информационно-консультационных центров должны возмещаться за счет поступлений за выполненные работы и оказанные услуги и ассигнований из федерального и местных бюджетов.