Основные направления и отдельные разделы Программы ежегодно будут корректироваться с учетом динамики социально-экономического развития страны, а также на основе результатов научных исследований, проводимых по этим проблемам. Предусмотрено также привлечение внебюджетных средств для реализации мероприятий Программы.
Для координации деятельности по реализации мероприятий Программы создается на общественных началах межведомственный совет, состоящий из ведущих специалистов заинтересованных министерств и ведомств. Основными его функциями должны быть контроль за реализацией Программы, подготовка и внесение предложений по ее корректировке, контроль за использованием выделенных финансовых средств, оценка эффективности программных мероприятий.
Кроме того, предусмотрены дальнейшее включение мероприятий, направленных на обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия и профилактику заболеваний населения, в федеральные целевые программы, программы социально-экономического развития регионов, а также разработка отраслевых программ по решению отдельных вопросов профилактики инфекционных и неинфекционных заболеваний.
Основные направления Программы должны осуществляться в рамках соответствующих региональных программ, разрабатываемых с учетом конкретной санитарно-эпидемиологической и экологической обстановки, состояния здоровья населения, уровня развития здравоохранения и санитарно-эпидемиологического обеспечения. Финансирование мероприятий будет осуществляться из местных бюджетов и внебюджетных источников.
Государственными заказчиками Программы являются Государственный комитет санитарно-эпидемиологического надзора Российской Федерации, Министерство здравоохранения и медицинской промышленности Российской Федерации и Российская академия медицинских наук.
Разработано технико-экономическое обоснование мероприятий Программы согласно приложению.