Стратегией развития железнодорожного транспорта в республике выбрано направление на транспортное обеспечение комплексного освоения и развития территории, расширение доступа отечественных поставщиков транспортных услуг на зарубежные рынки и превращение экспортно-транспортных услуг в один из источников дохода. Ключевым элементом для Республики Бурятия является Транссибирская железнодорожная магистраль - основа российской транспортной системы, имеющая перспективное ответвление на создаваемый коридор Улан-Удэ - Улан-Батор - Пекин - Тихоокеанские порты.
На Восточно-Сибирской железной дороге - филиале ОАО "Российские железные дороги" в среднесрочный период предусмотрено произвести модернизацию (развитие путевых хозяйств, электрификация) Южного хода (Улан-Удэ - Наушки).
В целях промышленного освоения месторождений Озерного рудного узла планируется создание технологического соединения БАМа и Транссибирской железнодорожной магистрали - "Могзон - Новый Уоян".