В своей деятельности Палата руководствуется Конституцией Российской Федерации, Бюджетным кодексом Российской Федерации, Федеральным законом "Об общих принципах организации и деятельности контрольно-счетных органов субъектов Российской Федерации и муниципальных образований", иными федеральными законами, Уставом (Основным Законом) Калининградской области, настоящим Законом, иными нормативными правовыми актами Калининградской области.
(в ред. Закона Калининградской области от 11.11.2011 N 48)
Палата обладает организационной и функциональной независимостью и осуществляет свою деятельность самостоятельно.