Поверхность Магаданской области покрыта густой и разветвленной речной сетью. В области насчитывается около 250 тысяч рек, из них около 97% - длиной менее 10 км. Все реки относятся к бассейнам Северного Ледовитого и Тихого океанов (178 тыс. рек и 68 тыс. рек, соответственно).
Самая крупная река области - Колыма, длина которой составляет 2129 км. Она образуется слиянием двух рек - Кулу и Аян-Юрях, берущих начало на восточном склоне Оймяконского нагорья. Ее бассейн расположен в районе самого сурового климата, более восьми месяцев она покрыта льдом. Некоторые ее притоки промерзают до дна.
Общие ресурсы поверхностных водных объектов по среднемноголетнему стоку оцениваются приблизительно в 100 куб. км/год, из них свыше 60 куб. км/год приходится на бассейн реки Колымы.
Общие (потенциальные) прогнозные эксплуатационные ресурсы подземных вод оцениваются в 39045,22 тыс. куб. м/сут., или 14,2 куб. км/год с минерализацией до 1 г/куб. дм, ультрапресные. В области разведано 88 месторождений пресных подземных вод. Эксплуатационные запасы утверждены в количестве 634,1 тыс. куб. м/сут., в том числе хозяйственно-питьевого назначения - 500,6 тыс. куб. м/сут. В настоящее время освоено 36 месторождений. Обеспеченность населения, как потенциальными ресурсами, так и разведанными запасами - высокая. Эти воды могут использоваться в бытовом и промышленном водоснабжении без предварительной очистки.
Природная питьевая вода характеризуется низким содержанием биогенных элементов (фтора, селена, йода, кальция, магния и др.).
Минеральные воды на территории области имеют ограниченное распространение. В настоящее время выявлено 9 источников термальных и холодных минеральных вод, на трех из них (Тальском, Мотыклейском и Таватумском) разведаны месторождения с подсчетом эксплуатационных запасов в количестве 1,2, 1,08 и 1,08 куб. м/сут. соответственно. Используются пока только два источника: Тальский и Таватумский.