На территории Природного парка могут выделяться следующие функциональные зоны, утверждаемые органом государственной власти автономного округа в соответствии с законодательством Российской Федерации и автономного округа:
- природоохранная зона: включает участки, предназначенные для использования в научных целях и выделяемые для обеспечения сохранения и восстановления редких и исчезающих видов животных и растений, а также иных биологических объектов;
- рекреационная зона: территория, на которой создаются благоприятные условия для развития экологического туризма, любительской охоты и рыболовства;
- зона охраны историко-культурных комплексов и объектов: территория, на которой создаются условия для сохранения историко-культурных комплексов и объектов.