Управление реализацией мероприятий программы осуществляет государственный заказчик - управление Алтайского края по транспорту, дорожному хозяйству и связи. Исполнителем мероприятий программы в 2009 - 2010 годах является краевое автономное учреждение "Алтайэлектротранс", в 2011 - 2012 годах исполнитель определяется на основании результатов торгов {в редакции постановления Администрации Алтайского края от 19 декабря 2011 года N 750.}.
Финансирование программы производится в порядке, установленном для исполнения краевого бюджета. Государственный заказчик утверждает ежегодный план реализации мероприятий программы, формы и сроки представления бухгалтерской и иной отчетности, осуществляет контроль за ходом реализации программы, проводит анализ эффективности ее выполнения, а также целевого использования финансовых средств.
Исполнитель мероприятий расходует денежные средства строго по целевому назначению в соответствии с законодательством Российской Федерации и Алтайского края. Также ежеквартально, до двадцатого числа месяца, следующего за отчетным, направляет государственному заказчику отчет о ходе выполнения программы, утвержденный управлением Алтайского края по транспорту, дорожному хозяйству и связи.
Отчеты о выполнении мероприятий программы представляются вышеуказанным государственным заказчиком в Главное управление экономики и инвестиций Алтайского края и комитет администрации Алтайского края по финансам, налоговой и кредитной политике по форме и в сроки, установленные порядком разработки, утверждения и реализации краевых целевых программ.