Департамент имеет право:
4.1. Запрашивать и получать от органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, учреждений и объединений Сахалинской области, независимо от их ведомственной принадлежности, информацию, необходимую для осуществления своих задач и функций.
4.2. Представлять в установленном порядке в федеральных органах государственной власти, судах интересы администрации Сахалинской области по вопросам, относящимся к компетенции Департамента.
4.3. Создавать советы, комиссии, рабочие группы по направлениям деятельности Департамента.
4.4. Владеть, пользоваться и распоряжаться имуществом, закрепленным за Департаментом на праве оперативного управления, в соответствии с законодательством Российской Федерации.
4.5. Пользоваться банком данных автоматизированной информационной системы администрации Сахалинской области.
4.6. Представлять работников курируемых отраслей к награждению правительственными и областными наградами и почетными грамотами.
4.7. Участвовать в разработке проектов соглашений, договоров Сахалинской области с другими субъектами Российской Федерации, федеральными органами исполнительной власти по вопросам, входящим в компетенцию Департамента.
4.8. По вопросам, отнесённым к полномочиям Департамента, издаёт нормативные правовые акты, обязательные для исполнения на всей территории Сахалинской области, в виде приказов Департамента. Приказы Департамента, носящие нормативный характер, подлежат опубликованию в газете "Губернские ведомости". Решения по текущим, оперативным, организационным и кадровым вопросам принимаются в виде приказов начальника Департамента.