Задачами Счетной палаты автономного округа являются:
1) осуществление финансового контроля за исполнением окружного бюджета и бюджета Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа;
2) проведение внешней проверки годовых отчетов об исполнении окружного бюджета и об исполнении бюджета Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа;
3) проведение экспертизы проектов законов автономного округа об окружном бюджете и бюджете Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа, проектов законов автономного округа о внесении изменений в законы автономного округа об окружном бюджете и бюджете Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа, проектов законов автономного округа об исполнении окружного бюджета и об исполнении бюджета Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа, иных законов, регулирующих бюджетные правоотношения;
4) проведение экспертизы проектов окружных долгосрочных целевых программ;
5) проведение проверки бюджетов муниципальных образований автономного округа - получателей межбюджетных трансфертов из окружного бюджета;
6) проведение в случаях, установленных бюджетным законодательством, внешней проверки годовых отчетов об исполнении местных бюджетов;
7) осуществление контроля за использованием, управлением и распоряжением государственной собственностью автономного округа;
8) осуществление финансового контроля за долговыми обязательствами автономного округа;
9) осуществление анализа итогов проводимых контрольных мероприятий, обобщение и исследование причин и последствий выявленных нарушений и отклонений от установленных показателей окружного бюджета и бюджета Окружного фонда обязательного медицинского страхования автономного округа, подготовка предложений, направленных на их устранение;
10) информирование Законодательного Собрания автономного округа о результатах контрольных мероприятий, проводимых Счетной палатой автономного округа.