Основными задачами территориальной комиссии являются:
ведение коллективных переговоров по подготовке проекта и заключению территориального соглашения;
рассмотрение вопросов по инициативе сторон территориальной комиссии, возникших в ходе выполнения территориального соглашения;
осуществление контроля за ходом выполнения территориального соглашения, разрешение разногласий, возникших в ходе его выполнения, а также урегулирование вопросов, по которым не достигнуто согласия.
Иные задачи территориальной комиссии определяются положением о территориальной комиссии.