Реализация мероприятий Программы осуществляется на основании договоров, заключенных между СНО (на правах заказчика) и подрядной организацией, которыми определяются конкретные права и обязанности сторон, сроки исполнения, порядок финансирования (оплаты), порядок приемки-передачи работ (товаров), ответственность сторон и иные условия сделки, предусмотренные гражданским законодательством и бюджетным законодательством.
Контроль за целевым использованием бюджетных средств, направленных на реализацию Программы, осуществляет комитет по агропромышленному и рыбохозяйственному комплексу Ленинградской области, администрации муниципальных образований Ленинградской области (в случае софинансирования мероприятий Программы за счет средств местного бюджета).
Контроль за финансированием мероприятий Программы осуществляет комитет финансов Ленинградской области.
Комитет по агропромышленному и рыбохозяйственному комплексу Ленинградской области представляет отчет о ходе реализации Программы ежеквартально в Комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области и ежегодно - в Правительство Ленинградской области.