В состав МАИС ЭГУ входят следующие подсистемы:
подсистема "Портал "Государственные и муниципальные услуги (функции) в Санкт-Петербурге";
подсистема "Реестр государственных и муниципальных услуг (функций) Санкт-Петербурга";
подсистема формирования и исполнения регламентов электронного взаимодействия;
подсистема мониторинга процессов предоставления государственных и муниципальных услуг;
подсистема информационной безопасности;
подсистема внутреннего электронного документооборота и делопроизводства многофункционального центра;
подсистема "Электронный архив";
подсистема "Кабинет согласований";
подсистема "Программный комплекс "Межведомственное взаимодействие".