Основным исполнителем Программы является Комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области, соисполнителями - комитет общего и профессионального образования Ленинградской области, управление делами Правительства Ленинградской области, предприятия и организации (на основе конкурса).
Комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области:
заключает договоры (государственные контракты) на выполнение мероприятий Программы в соответствии с действующим законодательством, в которых определяются права и обязанности сторон, сроки исполнения и объемы финансирования, ответственность за целевое использование средств, порядок предоставления отчетной документации;
осуществляет меры по реализации Плана мероприятий долгосрочной целевой программы "Поддержка инновационной деятельности в Ленинградской области на 2010-2015 годы";
обеспечивает информирование исполнительных органов государственной власти, органов местного самоуправления, общественных организаций и объединений предпринимателей о задачах Программы, положениях о конкурсах и результатах реализации Программы через средства массовой информации, официальный сайт Администрации Ленинградской области, посредством информационных писем.
Для осуществления оперативного контроля руководители органов исполнительной власти Ленинградской области, участвующих в реализации Программы, ежеквартально представляют в Комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области отчет о реализации мероприятий Программы (с использованием данных органов государственной статистики).
Информация о ходе реализации Программы ежегодно представляется в Правительство Ленинградской области.
Общий контроль за реализацией Программы осуществляет вице-губернатор Ленинградской области - председатель комитета экономического развития и инвестиционной деятельности.