На ООПТ Ленинградской области расположены 12 научно-исследовательских организаций, баз и станций: Биологический научно-исследовательский институт Санкт-Петербургского государственного университета, станция "Отрадное" Ботанического института Российской академии наук, Гидрологическая станция института озероведения (памятник природы "Озеро Красное"), Научно-исследовательская база Государственного научно-исследовательского института озерного и речного рыбного хозяйства (комплексный заказник "Сяберский"), Болотная станция Государственного гидрологического института (заказник "Болото Ламмин-Суо"), Научно-исследовательский стационар Научно-исследовательского института лесного хозяйства (природный парк "Вепсский лес"), Болотная станция Ботанического института имени В.Л.Комарова (комплексный заказник "Чистый мох"), экспериментальная станция Санкт-Петербургской лесотехнической академии (заказник "Лисинский"), база Санкт-Петербургского горного института (памятник природы "Саблинский"), база Института географии Санкт-Петербургского государственного университета (заказник "Кузнечное"). В течение многих десятилетий ведутся стационарные исследования на ООПТ "Раковые озера", "Озеро Мелководное", "Мшинское болото", "Выборгский", "Березовые острова", "Коккоревское", "Гонтовое болото", "Ингерманландский" и др. Накопленный научный потенциал позволяет использовать имеющуюся информацию при проектировании и инвентаризации территорий, устанавливать необходимые режимы охраны.
Для сохранения и развития ООПТ необходимо решить следующие задачи: провести инвентаризацию объектов особой охраны; организовать постоянный контроль (мониторинг) за состоянием охраняемых объектов; разработать методы охраны и использования рекреационного потенциала ООПТ и внедрить их в практику.
В 2009-2010 годах научно-исследовательские работы проводятся при разработке, актуализации проектов организации ООПТ, положений и планов управления ООПТ, в ходе мониторинга объектов растительного и животного мира, естественных экологических систем, природных ландшафтов и природных комплексов Ленинградской области, а также при подготовке уточненных списков растений и животных, включаемых в Красную книгу природы Ленинградской области.
В рамках поддержки развития ООПТ выполнены работы:
по мониторингу экосистем, лесных и болотных комплексов, объектов животного и растительного мира;
по инвентаризации природных комплексов и анализу форм хозяйственной деятельности на ООПТ;
по выявлению на ООПТ видов растений и животных, занесенных в красные книги;
по разработке методов сохранения биологического разнообразия;
по учету численности животных (птиц, ластоногих) на ООПТ;
по комплексным исследованиям и оценке экологического состояния природной среды ООПТ, разработке рекомендаций по сохранению природных комплексов и объектов;
по выявлению коренных старовозрастных лесов.
В результате научно-исследовательских работ получены и будут дополнены данные по фактическому состоянию природной среды ООПТ, даны рекомендации по сохранению природных комплексов и объектов, редких видов животных и растений. Особое внимание будет уделено ООПТ, имеющим высокую антропогенную нагрузку или попадающим в зону негативного воздействия крупных строительных объектов.