Совет обладает следующими полномочиями:
3.1. Принимать решения, имеющие рекомендательный характер, и осуществлять контроль за выполнением принятых решений по вопросам, относящимся к компетенции Совета, в соответствии с протоколами заседаний Совета.
3.2. Вносить в установленном порядке на рассмотрение Губернатора Санкт-Петербурга и Правительства Санкт-Петербурга предложения по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.3. Приглашать и заслушивать на своих заседаниях должностных лиц исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга, юридических и физических лиц, осуществляющих научную и научно-техническую деятельность на территории Санкт-Петербурга, по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.4. Участвовать в работе исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга, а также ученых советов научных организаций и образовательных учреждений, сотрудничать с образовательными, научными и иными организациями по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.5. Участвовать в разработке проектов правовых актов по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.6. Создавать секции, руководители которых избираются на заседании Совета.
3.7. Осуществлять иные полномочия, необходимые для решения задач, возложенных на Совет.