Инновационная деятельность в области основывается на следующих принципах:
1) комплексность - учет совокупности всех экономических, социальных, технологических, производственных, ресурсных, правовых, экологических, инвестиционных и иных факторов, характеризующих социально-экономическое развитие области и охватывающих весь жизненный цикл инноваций;
2) системность - осуществление инновационной деятельности во взаимодействии с органами государственной власти Российской Федерации, отраслевыми исполнительными органами государственной власти области, субъектами инновационной деятельности, специализированными коммерческими и некоммерческими организациями;
3) этапность - осуществление инновационной деятельности в соответствии с приоритетными направлениями социально-экономического развития области;
4) гласность - информирование населения о проводимой работе в области инновационной деятельности.