Основным исполнителем Программы является комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области, соисполнителем Программы является управление делами Правительства Ленинградской области.
Общий контроль за выполнением Программы осуществляет вице-губернатор Ленинградской области - полномочный представитель Губернатора Ленинградской области в Законодательном собрании Ленинградской области. Контроль за выполнением мероприятий Программы и целевым использованием финансовых средств осуществляет комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области. Контроль за финансированием мероприятий Программы осуществляет комитет финансов Ленинградской области.
Комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области ежеквартально представляет в комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области информацию о ходе финансирования и выполнения мероприятий Программы и ежегодно - доклад в Правительство Ленинградской области.