Основным исполнителем Программы является комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области, соисполнителем Программы - управление делами Правительства Ленинградской области.
Общий контроль за выполнением Программы осуществляет вице-губернатор Ленинградской области - полномочный представитель Губернатора Ленинградской области в Законодательном собрании Ленинградской области; контроль за выполнением мероприятий Программы осуществляет комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области; контроль по вопросам финансирования мероприятий Программы - комитет финансов Ленинградской области. Комитет по взаимодействию с органами местного самоуправления Ленинградской области ежеквартально представляет в комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области сведения о ходе финансирования и выполнения мероприятий Программы.