Основными задачами Совета являются:
2.1. Организация эффективной работы по достижению координированного межведомственного взаимодействия, обеспечению комплексного подхода к решению вопросов, связанных с противодействием эпидемии ВИЧ-инфекции в Санкт-Петербурге.
2.2. Изучение и обобщение опыта по противодействию эпидемии ВИЧ-инфекции в Санкт-Петербурге.
2.3. Экспертно-аналитическая деятельность по мониторингу и оценке программ и проектов по профилактике и борьбе с ВИЧ/СПИДом в Санкт-Петербурге.
2.4. Подготовка предложений Губернатору Санкт-Петербурга и Правительству Санкт-Петербурга по принятию мер, направленных на противодействие эпидемии ВИЧ-инфекции в Санкт-Петербурге.
2.5. Подготовка предложений для исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга по вопросам борьбы с ВИЧ/СПИДом в Санкт-Петербурге, координации деятельности государственных, общественных организаций для наиболее эффективного противодействия эпидемии ВИЧ/СПИДа в Санкт-Петербурге.
2.6. Методическая поддержка организаций, работающих в сфере профилактики и борьбы с ВИЧ/СПИДом в Санкт-Петербурге.
2.7. Взаимодействие и обмен информацией с организациями, работающими в области профилактики ВИЧ/СПИДа в Санкт-Петербурге.