Совет обладает следующими полномочиями:
3.1. Запрашивать от исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и организаций, а также должностных лиц информацию, документы и материалы, необходимые для решения задач, возложенных на Совет.
3.2. Создавать в необходимых случаях комиссии, рабочие и экспертные группы.
3.3. Приглашать на свои заседания должностных лиц исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и представителей организаций, а также заслушивать их на своих заседаниях по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.4. Принимать решения и осуществлять контроль за исполнением решений Совета.
3.5. Вносить в установленном порядке предложения в исполнительные органы государственной власти Санкт-Петербурга, территориальные органы федеральных органов исполнительной власти и организации по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.6. Привлекать для участия в работе Совета с правом совещательного голоса экспертов и специалистов в области рыболовства, рыбоводства и сохранения водных биологических ресурсов.
3.7. Осуществлять иные полномочия, необходимые для решения задач, возложенных на Совет.