Для выполнения задач комиссия осуществляет взаимодействие:
с комитетами образования муниципальных образований, финансирование которых осуществляется по методике целевого бюджетирования, ориентированного на результат, в целях принятия для рассмотрения проектов планов работы, представления утвержденных планов работы, принятия для рассмотрения обоснований необходимости внесения изменений в планы работы, представления утвержденных изменений планов работы, принятия представленных для рассмотрения отчетов о достижении поставленных целей и выполнении мероприятий;
с комитетом общего и профессионального образования Ленинградской области через представителей комитета - членов комиссии в целях представления утвержденных планов работы, представления утвержденных изменений планов работы, принятия на рассмотрение заключений комитета общего и профессионального образования Ленинградской области по проектам планов работы и результатам работы комитетов образования муниципальных образований.