В соответствии с возложенными задачами комиссия осуществляет следующие функции:
3.1. Согласовывает и утверждает цели, мероприятия по достижению целей, плановые значения показателей достижения целей и хода выполнения мероприятий планов работы в соответствии с целями, поставленными в основных направлениях политики в сфере образования Ленинградской области.
3.2. Утверждает отчеты по фактическому исполнению планов работы.
3.3. Согласовывает и утверждает изменения в целях, мероприятиях по достижению целей, в плановых значениях показателей достижения целей и хода выполнения мероприятий.
3.4. Анализирует достижения поставленных целей и проводимых мероприятий, а также вырабатывает по результатам анализа рекомендации по изменению планов работы.
3.5. Выполняет другие функции, связанные с целевой деятельностью и целевым финансированием учреждений образования (в том числе рассмотрение спорных вопросов и проблемных ситуаций) в рамках целевого бюджетирования, ориентированного на результат.