Зоопарк - единственный зоопарк в Северо-Западном федеральном округе. Коллекция животных Зоопарка является большой государственной ценностью и должна рассматриваться с точки зрения:
зрелищности и интереса со стороны посетителей;
научной и природоохранной ценности;
ценности для просветительской и образовательной работы.
На 1 января 2005 года коллекция животных Зоопарка насчитывает 1951 экземпляр 395 видов животных мировой фауны.
В настоящее время коллекция крупных видов велика для существующей территории, так как содержание медведей, крупных кошек, копытных не соответствует международным стандартам. Коллекция Зоопарка находится в динамическом развитии.
Дефицит площади - основная причина, сдерживающая увеличение многообразия коллекции. Пополнение коллекции новыми видами неизбежно влечет исчезновение и сокращение поголовья отдельных видов. Так, в последнее время сокращено количество лошадей Пржевальского, пекари и других стадных животных. В 2004 году коллекция сократилась на 13 видов.
Настоящая Концепция предусматривает оптимизацию состава коллекции животных, которую постепенно необходимо привести в соответствие с имеющимися условиями и в ряде случаев с минимальными международными стандартами содержания животных в условиях неволи.
Представляется нецелесообразным дополнять коллекцию животных на старой территории Зоопарка самыми крупными видами животных, такими как слоны, носороги. В данном случае следует сохранить только жирафов и бегемотов.
Предполагается также некоторое сокращение видового состава крупных животных - медведей и копытных животных - при реконструкции бурого медвежатника, степного загона и антилопника.
Для крупных животных, живущих сегодня в Зоопарке, необходимо найти место для передержки.
Средние и мелкие животные, в основном, содержатся с учетом международных стандартов.
Для увеличения привлекательности коллекции животных необходима постепенная замена малоактивных в дневное время животных на экспозиционно выигрышные виды.
Предполагается расширить программу обогащения искусственной среды обитания для более комфортного существования животных.
При введении новых экспозиций в здании экзотариума (террариума) и в детском зоопарке в ближайшие годы видовой состав коллекции Зоопарка планируется увеличить до 600 видов.