В архитектуре АИС ОБЖ должна использоваться эталонная модель взаимодействия открытых систем, что позволит обеспечивать информационное взаимодействие с вновь создаваемыми и внешними системами регионального и федерального уровня.
Межсистемные интерфейсы могут реализовываться на базе следующих существующих стандартов: стандарты UN/EDIFACT, разработанные Европейской экономической комиссией Организации Объединенных Наций и принятые в качестве международных стандартов; стандарты ISO серии 8613 "Обработка информации. Текстовые и учрежденческие системы. Архитектура, ориентированная на обработку учрежденческих документов (ODA), и формат обмена"; стандарты ISO серии 10021 "Информационная технология. Передача текстов. Системы обмена текстами в режиме сообщений (MOTIS)".