Основным исполнителем Программы является комитет экономического развития Ленинградской области, соисполнители - государственное учреждение "Агентство экономического развития Ленинградской области", открытое акционерное общество "Инновационное агентство Ленинградской области", созданное в результате реализации мероприятий Программы.
Выбор других соисполнителей мероприятий Программы осуществляется преимущественно на конкурсной основе. Организации, выбираемые в качестве соисполнителей работ, должны обладать практическим опытом проведения подобных работ, иметь устойчивую организационную структуру, а также достаточное число квалифицированных специалистов.