Основным исполнителем Программы является комитет по здравоохранению Ленинградской области, соисполнителями - органы местного самоуправления Ленинградской области. Общий контроль за выполнением Программы осуществляет вице-губернатор Ленинградской области, курирующий социальные вопросы.
Для осуществления оперативного контроля руководители учреждений и служб, участвующих в реализации Программы, представляют ежеквартально в комитет по здравоохранению Ленинградской области сведения о выполнении мероприятий и финансировании Программы.
Комитет по здравоохранению Ленинградской области ежеквартально направляет информацию о ходе финансирования и выполнения Программы в комитет по экономике и инвестициям Ленинградской области.