В структуру Территориальной системы экспертизы КМП входят независимые от подразделений здравоохранения и ОМС Санкт-Петербурга организации специалистов (экспертные организации), имеющие лицензию на экспертизу КМП и/или экспертов КМП в своем штате, и/или договоры с экспертами КМП.
Для проведения многосторонней (межведомственной) экспертизы КМП Комитетом по здравоохранению Санкт-Петербурга и ТФОМС Санкт-Петербурга совместно с ассоциацией врачей и страховщиков, другими заинтересованными лицами могут создаваться межведомственные экспертные комиссии, привлекаться независимые экспертные организации, в том числе и из других субъектов РФ.
Независимый и межведомственный экспертный контроль КМП может осуществляться в целях разрешения спорных ситуаций, возникающих в процессе производства ведомственной и вневедомственной экспертизы КМП.
Независимый и межведомственный экспертный контроль КМП может осуществляться при подготовке к внедрению в практику здравоохранения и ОМС управленческих, организационных, медицинских и иных нововведений, способных повлиять на состояние КМП, а также при оценке влияния данных нововведений на состояние КМП.
Для обеспечения возможности применения результатов независимого и межведомственного экспертного контроля и повышения его эффективности в целях улучшения КМП населению Санкт-Петербурга, а также для предупреждения понятийных и технологических разногласий группы (экспертные организации) и/или отдельные специалисты должны в своей работе пользоваться правилами производства экспертиз КМП, оформления и предоставления их результатов.
Лица (организации), привлекаемые к независимой или межведомственной экспертизе КМП, должны соответствовать требованиями к экспертам и организаторам экспертизы КМП.
Материалами для экспертизы КМП могут служить только технологические медицинские документы, содержащие информацию о ходе выполнения лечебно-диагностического процесса (история болезни, амбулаторная карта, карта вызова скорой медицинской помощи, карта санаторно-курортного лечения, карта ведения родов и т.п.).