Совет осуществляет следующие функции:
3.1. Разрабатывает предложения по формированию и развитию нормативно-правовой базы в сфере профессионального образования, науки и инновационной деятельности.
3.2. Проводит совместно с Комитетом по науке и высшей школе мониторинг состояния научно-образовательного и инновационного потенциала Санкт-Петербурга; разрабатывает меры по реализации процесса реформ, осуществляемых в сфере науки и профессионального образования; разрабатывает предложения по стратегии и приоритетным направлениям развития научно-образовательной и инновационной сферы Санкт-Петербурга; готовит предложения для Правительства Санкт-Петербурга по направлениям и рациональным формам взаимодействия в сфере науки, образования и инновационной деятельности с субъектами Российской Федерации, странами ближнего и дальнего зарубежья; принимает участие в проведении конкурсов приоритетных разработок, научно-технических программ и проектов, направленных на решение проблем социально-экономического развития Санкт-Петербурга.
3.3. Содействует организации экспертиз программ и проектов, направленных на решение важнейших социальных, экономических, научно-технических, технологических, экологических и других проблем Санкт-Петербурга, представляет научно-технические проекты и программы органам государственной экспертизы, готовит заключения по проектам программ, научным разработкам и другим документам, создаваемым по заказам исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга.
3.4. Формирует совместно с исполнительными органами государственной власти Санкт-Петербурга перечень региональных научно-технических и инновационных программ, содействует привлечению к их реализации финансовых ресурсов, разрабатывает предложения в годовые и перспективные планы научно-исследовательских программ и проектов по приоритетным направлениям научно-технической политики Санкт-Петербурга.
3.5. Рассматривает по поручению Губернатора Санкт-Петербурга и Правительства Санкт-Петербурга проекты и программы в научно-технической и инновационной сфере.
3.6. Разрабатывает предложения по формированию благоприятного инвестиционного климата для развития и эффективного использования научно-образовательного потенциала Санкт-Петербурга.
3.7. Разрабатывает совместно с Комитетом по науке и высшей школе комплексные годовые планы проведения конференций, организации выставочной и рекламно-издательской деятельности в сфере науки, инноваций и профессионального образования, освещения данной деятельности в средствах массовой информации.