Комитет по экономике и инвестициям как представитель заказчика программы возлагает на департамент развития малого предпринимательства комитета функции координатора по выполнению плана мероприятий Программы. Для выполнения указанной функции управления департамент, по мере необходимости, проводит рабочие совещания с участием представителей структурных подразделений Правительства Ленинградской области.
Департамент развития малого предпринимательства комитета ежеквартально проводит анализ выполнения Программы и готовит сводный отчет по достигнутым результатам реализации мероприятий на основании материалов, представленных подразделениями Правительства области. В случае необходимости осуществляется корректировка плана мероприятий. Сводный отчет представляется Губернатору Ленинградской области.
Департамент развития малого предпринимательства комитета обеспечивает подготовку распоряжений по финансированию мероприятий Программы для комитета финансов Ленинградской области, на основании которых комитет финансов осуществляет выделение средств из областного бюджета и контролирует их целевое использование.