Основными функциями комиссии являются:
а) утверждение внештатных специалистов - экспертов;
б) согласование программ (методическое руководство) по проведению аккредитации и лицензирования медицинской деятельности;
в) предварительное изучение подготовленных отделом материалов по аккредитации и лицензированию;
г) обсуждение материалов экспертизы соискателей лицензий на заседаниях комиссии и вынесение решения о возможности их аккредитации и лицензирования;
д) вынесение решений о приостановлении или возобновлении приостановленных сертификатов и лицензий, о передаче в суд дела об аннулировании лицензии.