Источниками формирования регионального продовольственного фонда являются:
переданные в собственность Ленинградской области средства федерального бюджета, направленные в 1994 году на создание регионального фонда зерна и переданные в последующие годы в управление, а затем во владение, пользование и распоряжение на формирование регионального продовольственного фонда, а также средства, начисленные в 1994-1998 годах в виде платы за пользование ими, и средства, начисленные в 1999-2000 годах пользователям в виде платы за пользование переданными во владение, пользование и распоряжение бюджетными средствами на формирование регионального продовольственного фонда;
проценты, полученные от юридических лиц за пользование бюджетными кредитами из средств регионального продовольственного фонда;
суммы пени, полученные от пользователей средств регионального продовольственного фонда за просрочку уплаты основной суммы долга, а также процентов за пользование средствами регионального продовольственного фонда;
суммы штрафов, уплачиваемых пользователями средств регионального продовольственного фонда, допустившими их использование не по целевому назначению.