Основными функциями Совета являются:
3.1. Выявление и обобщение проблем развития морской индустрии и судоходства в Санкт-Петербурге.
3.2. Подготовка предложений, рекомендаций, программ, участие в подготовке проектов правовых актов по вопросам повышения эффективности деятельности организаций в морской и речной сфере.
3.3. Подготовка предложений, рекомендаций и программ по укреплению позиций Санкт-Петербурга как морской столицы Российской Федерации, предложений по проведению массовых мероприятий, морских фестивалей и праздников.
3.4. Подготовка предложений и рекомендаций по проведению части юбилейной программы празднования 300-летия Санкт-Петербурга, связанной с морской тематикой.