Экологическое состояние водных объектов, находящихся на территории города, в значительной мере определяется совокупным воздействием многих техногенных факторов, из которых наиболее значительными являются: сброс в водные системы неочищенных или недостаточно очищенных сточных вод от коммунальных и промышленных объектов через канализационные системы; поступление загрязненных талых и дождевых вод с улиц, площадей и в целом с селитебной территории и с промплощадок; бытовые и производственные свалки в пределах водосборной площади; выбросы от промышленных предприятий и автомобильного транспорта; рекреационная нагрузка в местах организованного и неорганизованного отдыха населения.
Степень влияния антропогенной нагрузки на водные объекты зависит не только от объема и химического состава сбрасываемых загрязняющих веществ, но и от гидрологических условий и процессов самоочищения. Таким образом, качество поверхностных вод на урбанизированной территории следует рассматривать как результат сложного совместного действия разнонаправленных процессов загрязнения и самоочищения.
Несмотря на работы, проводимые на водотоках и водоемах города, неблагоприятная экологическая обстановка сложилась на многих водных объектах города: озеро Сестрорецкий Разлив, р.Охта, р.Ижора, р.Славянка др. Первоочередные мероприятия предлагается провести на озере Сестрорецкий Разлив и в бассейне реки Охты.