Финансирование основных мероприятий Программы осуществляется за счет внебюджетных средств.
Общий объем финансирования мероприятий Программы по погашению и обслуживанию кредитов в период с 2006 по 2016 год, предоставляемых для исполнения обязательств ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга" по выкупу ЮЗОС в собственность Санкт-Петербурга, составит 119,9 млн.евро, в том числе ежегодно с 2006 по 2016 год в соответствии с Перечнем мероприятий Программы по погашению и обслуживанию кредитов в период с 2006 по 2016 год, предоставляемых ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга" для финансирования затрат по выкупу ЮЗОС в собственность Санкт-Петербурга.
Ежегодно в бюджет Санкт-Петербурга включается объем средств для финансирования мероприятий Программы в соответствии с Перечнем мероприятий Программы по погашению и обслуживанию кредитов в период с 2006 по 2016 год, предоставляемых ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга" для финансирования затрат по выкупу ЮЗОС в собственность Санкт-Петербурга (за исключением средств на финансирование выплат процентов, комиссий и других обязательных платежей в 2006 году).
Финансирование мероприятий Программы по погашению и обслуживанию кредитов в период с 2006 по 2016 год, предоставляемых ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга" для финансирования затрат по выкупу ЮЗОС в собственность Санкт-Петербурга, за счет средств бюджета Санкт-Петербурга осуществляется при наступлении особых обстоятельств, предусмотренных Соглашением о поддержке проекта между Санкт-Петербургом, ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга", Северным инвестиционным банком и Европейским банком реконструкции и развития, заключенным в связи с осуществлением ГУП "Водоканал Санкт-Петербурга" мероприятий по выкупу ЮЗОС в собственность Санкт-Петербурга.
Годовой объем финансирования мероприятий Программы, включаемый в бюджет Санкт-Петербурга, устанавливается в рублевом эквиваленте на основе курса обмена, который прогнозируется на каждый соответствующий год Министерством экономического развития и торговли Российской Федерации (или в случае отсутствия такого прогнозируемого курса на основе другого курса, превалирующего на международных рынках).