В настоящее время органами ведомственного контроля являются:
- Ревизионное управление Комитета финансов;
- контрольные органы исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга;
- территориальные финансовые управления административных районов Санкт-Петербурга;
- Контрольно-счетная палата Законодательного Собрания Санкт-Петербурга.
Расходы средств федерального бюджета контролируются Контрольно-ревизионным управлением Министерства финансов Российской Федерации.
Основной функцией ведомственного контроля является проверка целевого использования бюджетных средств. Решение этой задачи осложнено из-за отсутствия точных методик оценки целевого использования бюджетных средств. Результаты ведомственных проверок направляются руководству для принятия решений, но собственно контроль за процессом исправления выявленных нарушений оказывается вне сферы деятельности контрольных органов.
Целью реформирования системы финансового контроля является повышение эффективности ведомственного контроля исполнения бюджета Санкт-Петербурга и целевого использования средств, а также дополнение ведомственного контроля внешним независимым контролем.
Основными направлениями реформирования являются:
разработка критериев целевого использования бюджетных средств и закрепление их в нормативных документах;
разработка единых для всех ведомственных контрольных органов принципов организации финансового контроля;
обеспечение широкой гласности и информирования общественности о результатах проверок и исправлении выявленных нарушений через средства массовой информации;
определение целей внешнего независимого финансового контроля и создание правовых и финансовых условий для его реализации;
введение в практику систематического хозяйственного аудита управления имуществом в учреждениях и органах государственной власти;
построение системы хозяйственного аудита государственных унитарных предприятий, находящихся в собственности Санкт-Петербурга, в первую очередь аудита локальных монополистов.