Основными задачами Комитета являются:
2.1. Осуществление контроля за деятельностью исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга, государственных унитарных предприятий, учреждений Санкт-Петербурга, а также за исполнением возложенных на их руководителей функциональных обязанностей.
2.2. Осуществление контроля и проверка исполнения исполнительными органами государственной власти Санкт-Петербурга и должностными лицами, а также государственными унитарными предприятиями и учреждениями Санкт-Петербурга законов и иных правовых актов Российской Федерации и Санкт-Петербурга.
2.3. Организация контроля и проверка деятельности отраслевых органов государственной власти Санкт-Петербурга совместного подчинения с органами исполнительной власти Российской Федерации и Ленинградской области.
2.4. Контроль и проверка деятельности структурных подразделений Канцелярии Администрации Санкт-Петербурга.
2.5. Контроль и проверка исполнения поручений губернатора Санкт-Петербурга.
2.6. Подготовка для губернатора Санкт-Петербурга на основании проведенных проверок информации о предупреждении нарушений и совершенствовании деятельности исполнительных органов государственной власти Санкт-Петербурга.
2.7. Осуществление контроля за исполнением планов социально-экономического развития и целевых программ Санкт-Петербурга.
2.8. Организация контроля и проверки использования собственности Санкт-Петербурга и расходования финансовых средств исполнительными органами государственной власти Санкт-Петербурга и должностными лицами, а также государственными унитарными предприятиями и учреждениями Санкт-Петербурга.
2.9. Осуществление взаимодействия с органами контроля и надзора федеральных органов исполнительной власти при проведении проверок на территории Санкт-Петербурга.