Ведение единой классификации осуществляется централизованно в автоматизированной системе ведения глобальных классификаторов - администратором глобальных классификаторов ЕСЭДД. На этапе внедрения ЕСЭДД функции администратора глобальных классификаторов выполняет государственное предприятие "Центр компьютерных разработок".
В рамках ЕСЭДД все базовые автоматизированные системы ЕСЭДД (системы делопроизводства, банки документов, индивидуальные системы делопроизводства) обязаны использовать коды структурных подразделений, сотрудников и организаций только из единой классификации. Используемые в базовых автоматизированных системах ЕСЭДД копии единой классификации не должны допускать их локальной модификации пользователями.
После внесения изменений и дополнений в автоматизированную систему ведения глобальных классификаторов данные о новых кодах структурных подразделений, сотрудников и организаций должны быть доведены администратором глобальных классификаторов ЕСЭДД до сведения территориальных и отраслевых органов Администрации Санкт-Петербурга, изменения кодов также должны быть внесены в настройку соответствующих автоматизированных систем.